Cybernetics And Systems Analysis logo
Информация редакции Аннотации статей Авторы Содержание
КИБЕРНЕТИКА И СИСТЕМНЫЙ АНАЛИЗ
Международний научно-теоретический журнал
УДК 519.217.2
И.В. Сергиенко, А.М. Гупал, А.В. Островский

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ EM-АЛГОРИТМА ДЛЯ КЛАССИФИКАЦИИ ГЕНОВ

Аннотация. EM-алгоритм для задачи разделения смесей распределений, описанных цепями Маркова, и связанная с ней проблема максимизации взвешенного правдоподобия. Предложены вспомогательные алгоритмы для выбора начального приближения и оптимального числа компонентов смеси, а также метод аппроксимации смеси распределений на основе известных данных с помощью метода опорных векторов. Полученные результаты применены к задаче классификации фрагментов генов.

Ключевые слова: цепь Маркова, классификация, ген, биоинформатика, нуклеотид, экзон, интрон, правдоподобие.



ПОЛНЫЙ ТЕКСТ

Сергиенко Иван Васильевич,
академик НАН Украины, директор Института кибернетики им. В.М. Глушкова НАН Украины, Киев,
e-mail: aik@public.icyb.kiev.ua.

Гупал Анатолий Михайлович,
чл.-кор. НАН Украины, профессор, заведующий отделом Института кибернетики им. В.М. Глушкова НАН Украины, Киев,
e-mail: gupal_anatol@mail.ru.

Островский Алексей Викторович,
младший научный сотрудник Института кибернетики им. В.М. Глуш¬кова НАН Украины, Киев,
e-mail: ostrovski.alex@gmail.com.

© 2015 Kibernetika.org. All rights reserved.