Cybernetics And Systems Analysis logo
Інформація редакції Аннотації статей Автори Зміст
Кібернетика і Системний Аналіз
Міжнародний Науково-Теоретичний Журнал
УДК 519.217.2
І.В. Сергієнко , А.М. Гупал, О.В. Островський

ПРОГНОЗУВАННЯ СТРУКТУРИ ГЕНІВ З ВИКОРИСТАННЯМ СУМІШЕЙ ЙМОВІРНІСНИХ РОЗПОДІЛІВ

Анотація. Розглянуто задачу відновлення послідовності прихованих станів для сумішей розподілів, що описуються узагальненнями ланцюгів Маркова довільного порядку і прихованих марковських моделей. Запропоновано алгоритм динамічного програмування для розв’язання цієї задачі, а також його модифікації, що направлені на усунення рекурсії та скорочення перебору. Отримані результати застосовано до задачі розпізнавання фрагментів генів у геномах рослин.

Ключові слова: ланцюг Маркова, приховані змінні, ген, біоінформатика, нуклеотид, екзон, інтрон, правдоподібність.



ПОВНИЙ ТЕКСТ

Сергиенко Иван Васильевич,
академик НАН Украины, директор Института кибернетики им. В.М. Глушкова НАН Украины, Киев,
e-mail: aik@public.icyb.kiev.ua.

Гупал Анатолий Михайлович,
чл.-кор. НАН Украины, доктор физ.-мат. наук, профессор, заведующий отделом Института кибернетики им. В.М. Глушкова НАН Украины, Киев, e-mail: gupal_anatol@mail.ru.

Островский Алексей Викторович,
кандидат физ.-мат. наук, младший научный сотрудник Института кибернетики им. В.М. Глушкова НАН Украины, Киев,
e-mail: ostrovski.alex@gmail.com.

© 2015 Kibernetika.org. All rights reserved.