Аннотация. Рассмотрена задача восстановления последовательности скрытых состояний для смесей распределений, описываемых обобщениями цепей Маркова произвольного порядка и скрытых марковских моделей. Предложен алгоритм динамического программирования для решения этой задачи, а также его модификации, направленные на устранение рекурсии и сокращение перебора. Полученные результаты применены к задаче распознавания фрагментов генов в геномах растений.

Ключевые слова: цепь Маркова, скрытые переменные, ген, биоинформатика, нуклеотид, экзон, интрон, правдоподобие.